V mikroskopickej sfére laboratória a zložitých prevádzkových nastaveniach lekárskej praxe slúži Pasteurova pipeta ako tichý „malý asistent“. Napriek svojmu štíhlemu tvaru hrá nenahraditeľnú úlohu v kritických procesoch,-ako je manipulácia so vzorkami a prenos tekutín-, pričom poskytuje presnosť a spoľahlivosť hladkému vykonávaniu vedeckého výskumu a lekárskej práce.
V biologických laboratóriách je Pasteurova pipeta neoceniteľným nástrojom pre úlohy siahajúce od bunkovej kultúry až po mikrobiálnu analýzu.
Pri vykonávaní subkultivácie buniek musia výskumníci preniesť bunky z ich pôvodných kultivačných baniek do nových.
Pasteurova pipeta využíva svoje schopnosti presnej{0}}manipulácie s kvapalinou a umožňuje starostlivé nasávanie bunkového -kultivačného média-, čím zabraňuje poškodeniu buniek- pred ich presným prenesením do nového kultivačného prostredia, čím podporuje optimálne podmienky pre rast a proliferáciu buniek.
V oblasti mikrobiálnej analýzy sa Pasteurove pipety používajú na nasávanie roztokov vzoriek pre postupy, ako je riedenie a očkovanie.
Pri testovaní bakteriálneho obsahu vo vzorkách vody sa na sériové riedenie vzorky používa Pasteurova pipeta; vzorky v rôznych úrovniach riedenia sa potom naočkujú na kultivačné médium, aby sa umožnilo presné stanovenie počtu baktérií, čím sa poskytnú spoľahlivé údaje na hodnotenie kvality vody.
Pasteurove pipety zohrávajú dôležitú úlohu aj v chemických laboratóriách. Pri príprave a prenose roztokov umožňujú presné nasávanie a dávkovanie rôznych chemických činidiel.
V prípade experimentov s mimoriadne prísnymi požiadavkami na koncentráciu-ako sú experimenty s kvantitatívnou analýzou v analytickej chémii-zaisťuje presnosť Pasteurovej pipety presnosť a spoľahlivosť výsledkov experimentu.
Okrem toho sa v experimentoch, ako je chromatografická analýza, Pasteurove pipety používajú na natiahnutie roztokov vzoriek na injekciu, čím sa zabezpečí jednotnosť a stabilita vzoriek.